More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0862 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  100 
 
 
336 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  93.37 
 
 
329 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  90.36 
 
 
336 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  93.44 
 
 
331 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  86.38 
 
 
334 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  83.23 
 
 
332 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  70 
 
 
334 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  62.8 
 
 
326 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  62.69 
 
 
344 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  64.71 
 
 
326 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  67.91 
 
 
304 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  63.41 
 
 
332 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  68.2 
 
 
346 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  62.05 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  63.72 
 
 
345 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  63.11 
 
 
319 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.58 
 
 
328 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.27 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  63.61 
 
 
305 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.21 
 
 
309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.27 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  62.03 
 
 
305 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.37 
 
 
304 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  62.03 
 
 
305 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  62.03 
 
 
305 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  62.03 
 
 
305 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  62.03 
 
 
305 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  61.29 
 
 
321 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.5 
 
 
305 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  62.41 
 
 
304 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  70.04 
 
 
304 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  58.17 
 
 
318 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  58.17 
 
 
318 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  61.38 
 
 
304 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  59.8 
 
 
301 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.83 
 
 
306 aa  368  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  63.7 
 
 
306 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.26 
 
 
311 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.69 
 
 
319 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  62.77 
 
 
307 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  63.36 
 
 
304 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  65.11 
 
 
307 aa  362  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  62.77 
 
 
304 aa  362  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  58.03 
 
 
304 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  58.03 
 
 
304 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  58.03 
 
 
304 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.51 
 
 
312 aa  359  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  61.38 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  59.93 
 
 
300 aa  345  5e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  55.91 
 
 
319 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.64 
 
 
311 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.69 
 
 
316 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.69 
 
 
316 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  46.98 
 
 
310 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  45.58 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  41.8 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  40.13 
 
 
326 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  44.07 
 
 
305 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  43.99 
 
 
284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.73 
 
 
305 aa  235  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  41.01 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.1 
 
 
359 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  39.09 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  40.47 
 
 
369 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  40.51 
 
 
369 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  41.7 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.01 
 
 
429 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  43.99 
 
 
403 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  43.75 
 
 
282 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.82 
 
 
318 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  40.64 
 
 
284 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  39.25 
 
 
286 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.77 
 
 
284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  40.66 
 
 
326 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  40.99 
 
 
284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.85 
 
 
376 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43.06 
 
 
345 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  41.14 
 
 
356 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  43.45 
 
 
398 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.67 
 
 
309 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  41.37 
 
 
311 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  41.37 
 
 
311 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  42.31 
 
 
308 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.79 
 
 
328 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  37.9 
 
 
322 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  44.81 
 
 
439 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  41.03 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  41.03 
 
 
284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  39.38 
 
 
406 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  40.69 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  40.85 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  41.24 
 
 
291 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  40.27 
 
 
312 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>