More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3421 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  100 
 
 		 402 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  82.93 
 
 		 456 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  75.07 
 
 		 381 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  75 
 
 		 406 aa  554  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  76.06 
 
 		 403 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  78.13 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.38 
 
 		 392 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.38 
 
 		 392 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  74.38 
 
 		 392 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  74.54 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  67.03 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  69.06 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.29 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.4 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  61.9 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  58.86 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  59.88 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.62 
 
 		 328 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  61.17 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  61.2 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  61.46 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  63.48 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  63.54 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  63.95 
 
 		 315 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  56.79 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  57.19 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  57.23 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.55 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  55.93 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  60.87 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  57.42 
 
 		 336 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  61.02 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  58 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.29 
 
 		 359 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  49.36 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  55.28 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  52.61 
 
 		 312 aa  296  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.83 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  44.94 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  49.48 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  42.48 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  41.94 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  41.59 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  41.59 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  41.96 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  41.59 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.96 
 
 		 322 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  41.59 
 
 		 322 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.59 
 
 		 321 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.59 
 
 		 321 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  43.52 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.75 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.75 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  48.08 
 
 		 304 aa  260  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  43.35 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  45.08 
 
 		 315 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  46.53 
 
 		 310 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  45.58 
 
 		 312 aa  253  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  44.22 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  39.25 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  43.24 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.53 
 
 		 327 aa  239  8e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.73 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.26 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.26 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.26 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  42.32 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.26 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  39.93 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  38.24 
 
 		 305 aa  226  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.93 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.59 
 
 		 316 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.59 
 
 		 316 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  39.35 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  39.35 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  39.35 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.07 
 
 		 311 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.07 
 
 		 311 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  39.42 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  38.46 
 
 		 317 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  39.09 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  47.27 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.26 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  39 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  40.73 
 
 		 317 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.98 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  40.46 
 
 		 310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40.21 
 
 		 336 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.14 
 
 		 312 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  39.32 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  41.53 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  40.13 
 
 		 304 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  39.93 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>