More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01652 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  100 
 
 
321 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  82.5 
 
 
319 aa  544  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  75.62 
 
 
318 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  75 
 
 
318 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.28 
 
 
309 aa  424  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  66.55 
 
 
304 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.69 
 
 
305 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  65.22 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.36 
 
 
305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  65.22 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  65.22 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  64.77 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  65.22 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  65.22 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.86 
 
 
304 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  66.55 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  63.55 
 
 
329 aa  397  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  63.04 
 
 
329 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  61.25 
 
 
344 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  58.41 
 
 
336 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  60.84 
 
 
336 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  65.47 
 
 
345 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.52 
 
 
328 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  63.45 
 
 
331 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  64.16 
 
 
328 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  62.59 
 
 
334 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  59.94 
 
 
326 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  68.46 
 
 
304 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.71 
 
 
305 aa  374  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.43 
 
 
306 aa  371  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  57.4 
 
 
332 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.12 
 
 
334 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  62 
 
 
301 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  65.16 
 
 
307 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  60 
 
 
319 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  57.91 
 
 
326 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  60.62 
 
 
304 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  65.07 
 
 
312 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  64.89 
 
 
304 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  61.79 
 
 
304 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  61.79 
 
 
304 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  61.79 
 
 
304 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  60.62 
 
 
304 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  61.17 
 
 
305 aa  361  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  61.41 
 
 
304 aa  361  9e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  60.74 
 
 
306 aa  359  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  61.79 
 
 
300 aa  353  2e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  62.82 
 
 
307 aa  352  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.03 
 
 
311 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.51 
 
 
319 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  46.98 
 
 
304 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  44.52 
 
 
310 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.46 
 
 
305 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.14 
 
 
305 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  45.51 
 
 
369 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  39.29 
 
 
327 aa  245  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  44.87 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  38.78 
 
 
356 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  39.48 
 
 
309 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  36.73 
 
 
326 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  40.45 
 
 
310 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  42.03 
 
 
311 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43 
 
 
316 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43 
 
 
316 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  36.31 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  44.64 
 
 
429 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  45.45 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  40.8 
 
 
311 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  41.82 
 
 
304 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  40.8 
 
 
311 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43 
 
 
345 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.06 
 
 
359 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  42.36 
 
 
394 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  43.9 
 
 
398 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  42.09 
 
 
406 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  40.06 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.32 
 
 
303 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.5 
 
 
328 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  42.4 
 
 
308 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  42.05 
 
 
309 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.66 
 
 
314 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.27 
 
 
311 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  40.6 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.52 
 
 
315 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.22 
 
 
318 aa  222  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  43.75 
 
 
439 aa  222  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  41.18 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>