More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0462 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  100 
 
 
304 aa  610  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  47.06 
 
 
284 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  47.22 
 
 
284 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  45.67 
 
 
282 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  45.33 
 
 
284 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  46.85 
 
 
284 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  45.36 
 
 
286 aa  275  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  45.67 
 
 
284 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.67 
 
 
284 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.75 
 
 
286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  46.5 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  47.27 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  46.15 
 
 
284 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  45.86 
 
 
291 aa  261  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.16 
 
 
286 aa  258  9e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  44.16 
 
 
286 aa  258  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  46.74 
 
 
289 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  44.63 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.06 
 
 
281 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  41.72 
 
 
319 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.12 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  40 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  41.45 
 
 
321 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  39.93 
 
 
344 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  40.21 
 
 
329 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  41.58 
 
 
304 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.07 
 
 
304 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.86 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  39.08 
 
 
318 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.52 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  39.08 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  38.98 
 
 
301 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.5 
 
 
328 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.81 
 
 
311 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.5 
 
 
328 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  41.33 
 
 
331 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  40.48 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  40.48 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  39.8 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  40.48 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  40.21 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.59 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  41.52 
 
 
332 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  40.71 
 
 
346 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  40.57 
 
 
332 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  39.52 
 
 
336 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  39.53 
 
 
336 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  42.29 
 
 
304 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  39.51 
 
 
319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  38.21 
 
 
326 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  36.56 
 
 
326 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  42.08 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  39.66 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.72 
 
 
334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  39.19 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  39.78 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  36.88 
 
 
406 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  38.98 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  40.29 
 
 
304 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  39.31 
 
 
306 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  38.82 
 
 
310 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  39.18 
 
 
305 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  37.07 
 
 
369 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  40.26 
 
 
322 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  39.62 
 
 
322 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.25 
 
 
359 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  36.77 
 
 
401 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  37.71 
 
 
369 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  40.26 
 
 
322 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  36.99 
 
 
309 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.61 
 
 
322 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.61 
 
 
321 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  39.61 
 
 
322 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  39.61 
 
 
322 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.61 
 
 
321 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  39.61 
 
 
321 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  39.61 
 
 
322 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.42 
 
 
306 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  39.18 
 
 
304 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  36.64 
 
 
456 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.49 
 
 
376 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  39.73 
 
 
305 aa  205  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  39.73 
 
 
305 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.02 
 
 
314 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  35.71 
 
 
403 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  38.08 
 
 
402 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  40.26 
 
 
322 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>