More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  100 
 
 		 378 aa  762    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  45.28 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  47.1 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  47.12 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.62 
 
 		 294 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  45.68 
 
 		 300 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  47.92 
 
 		 297 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  43.88 
 
 		 279 aa  232  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  43.17 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  41.67 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  45.29 
 
 		 292 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  36.64 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  48.72 
 
 		 176 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  30.82 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.49 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.49 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  30.49 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  30.49 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.49 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  30.49 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  29.51 
 
 		 322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  30.16 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  45.22 
 
 		 118 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  29.13 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  29.72 
 
 		 322 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  29.79 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.23 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  25.39 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  29.41 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  28.81 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0404  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.75 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  31.52 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  28.71 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  28.71 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  27.92 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  27.56 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  27.56 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  29.32 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  28.95 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  28.57 
 
 		 284 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  27.27 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.42 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  28.43 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  26.77 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  28.09 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  28.83 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  29.04 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  25.85 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.65 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  27.78 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  27.95 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.44 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.91 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  27.37 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  27.03 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  30.74 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  28.12 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  25.51 
 
 		 394 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  25.56 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  25.36 
 
 		 282 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.37 
 
 		 284 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  27.5 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  26.58 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  27.05 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  27.37 
 
 		 284 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  28.09 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  26.86 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  27.15 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.57 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  27.76 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  26.99 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  25.58 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1074  band 7 protein  29.22 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.09 
 
 		 286 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  28.57 
 
 		 286 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  24.62 
 
 		 326 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  27.48 
 
 		 310 aa  89.7  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  26.09 
 
 		 398 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  24.52 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  27.3 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.71 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  27.84 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.78 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  30.45 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  29.1 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  27.99 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  27.42 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.33 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.1 
 
 		 293 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  26.85 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.67 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  27.06 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.66 
 
 		 296 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.97 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.5 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  27.07 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  26.67 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  27.84 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.11 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>