More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  60.8 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.2 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  40.82 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  41.64 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  36.03 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  37.96 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  36.46 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  36.23 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  37.78 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  34.21 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  31.73 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  38.04 
 
 		 176 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  27.24 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  27.91 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.73 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  25.77 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  37.39 
 
 		 118 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  26.07 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  23.86 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  22.68 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  27.89 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  26.85 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  22.97 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  25.44 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  21.71 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.51 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  24.13 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  20.7 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.74 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  25.09 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  26.04 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  28.85 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  27.44 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  23.31 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.13 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  22.54 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  23.64 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  24.72 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  26.39 
 
 		 367 aa  68.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  25.08 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  24.3 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  23.08 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.61 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  26.36 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  28.26 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.31 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.31 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  25.31 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  25.31 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  25.47 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  24.9 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.31 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  25.31 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  24.48 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  25.31 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  23.21 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  24.9 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  20.13 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  22.46 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  24.48 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  26.32 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  21.5 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  24 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  23.43 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  23.67 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  24.5 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  22.37 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  23.64 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  25.09 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  23.26 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  27.02 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.95 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  21.96 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  22.89 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  25.09 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  27.11 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  23.51 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.62 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  23.57 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  26.07 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  21.9 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  21.9 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  22.26 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  19.93 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  22.68 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  24.18 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  27.19 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  24.67 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  22.76 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.08 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.41 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.41 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  22.8 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.52 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.36 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  26.95 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  26.86 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>