More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0649 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  100 
 
 
300 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.84 
 
 
294 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  44.97 
 
 
378 aa  241  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  43.12 
 
 
299 aa  240  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  40.55 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  42.91 
 
 
322 aa  231  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  45.19 
 
 
304 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  41.97 
 
 
297 aa  211  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  38.93 
 
 
279 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  38.46 
 
 
311 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  41.64 
 
 
304 aa  203  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  44.62 
 
 
292 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  46.67 
 
 
176 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  44.86 
 
 
118 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.03 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  28.03 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.03 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  28.03 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  28.03 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.03 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  28.03 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  27.34 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  27.67 
 
 
322 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  27.34 
 
 
322 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  25.27 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  26.91 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  25.83 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  25.96 
 
 
321 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  26.44 
 
 
312 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  27.88 
 
 
329 aa  85.5  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  25.81 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  25.17 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  27.96 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  27.18 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  27.18 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  24.92 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  26.5 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  27.48 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.69 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  25.09 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.74 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.74 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  24.64 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  26.41 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.68 
 
 
328 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.93 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  23.66 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.53 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.27 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  26.36 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.36 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  24.01 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  26.13 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  23.19 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  25.87 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  25.82 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  23.19 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  23.19 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  30.11 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  22.88 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  25.58 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  23.53 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  25.58 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.57 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.03 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  24.65 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  26.55 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.08 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.08 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  24.64 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  26.07 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  22.46 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  26.14 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.08 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  27.23 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  24.12 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  22.86 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.53 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  27.23 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  24.91 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  25.99 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  29.03 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  22.86 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  29.03 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  26.89 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  29.03 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  22.86 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  23.53 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  28.79 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  24.91 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  23.08 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  27.07 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.03 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  22.88 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>