85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0050 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  53.55 
 
 
297 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  48.85 
 
 
304 aa  160  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  46.95 
 
 
279 aa  158  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  49.67 
 
 
327 aa  144  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  53.59 
 
 
322 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  48.72 
 
 
378 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  44.51 
 
 
292 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.38 
 
 
294 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  46.67 
 
 
300 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  37.06 
 
 
299 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  40 
 
 
311 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  38.04 
 
 
304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17332  predicted protein  28.14 
 
 
385 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  31.08 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  31.08 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  31.08 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  29.73 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  31.08 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  26.59 
 
 
310 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  31.09 
 
 
284 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  25.79 
 
 
311 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  21.66 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  29.05 
 
 
297 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  32.97 
 
 
268 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.36 
 
 
304 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.16 
 
 
310 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  22.36 
 
 
326 aa  45.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  26.8 
 
 
285 aa  45.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.97 
 
 
268 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  32.97 
 
 
268 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  26.28 
 
 
304 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.15 
 
 
285 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  28.57 
 
 
392 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  29.49 
 
 
381 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  23.75 
 
 
312 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  27.27 
 
 
399 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  23.72 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  29.05 
 
 
297 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  23.72 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  23.72 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  23.72 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  23.72 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  25.79 
 
 
312 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 
310 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 
310 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  29.05 
 
 
297 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  18.59 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  29.33 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  25.79 
 
 
312 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  24.36 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  24.36 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  28 
 
 
289 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  25.79 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  32.97 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  25.79 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  24.36 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  27.56 
 
 
409 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  22.01 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  24.36 
 
 
301 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  29.36 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.36 
 
 
306 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  27.7 
 
 
297 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  22.73 
 
 
305 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  22.64 
 
 
356 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  22.73 
 
 
305 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  23.67 
 
 
345 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  24.36 
 
 
304 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  20.73 
 
 
308 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  21.89 
 
 
333 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  26.74 
 
 
315 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.32 
 
 
314 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  28.21 
 
 
386 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.16 
 
 
305 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  28.21 
 
 
380 aa  40.8  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  22.22 
 
 
304 aa  40.8  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  23.78 
 
 
290 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>