More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1141 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  75.08 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  79.79 
 
 		 322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  45.58 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.84 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  45.49 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  39.78 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  41.7 
 
 		 279 aa  219  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  47.21 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  41.73 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  36.23 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  34.75 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  48.85 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  26.97 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  54.08 
 
 		 118 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.52 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  32.89 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  32.46 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  32.46 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  32.02 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.02 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.02 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  32.02 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  32.02 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.02 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  32.02 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  32.02 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  28.73 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  23.68 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  24.67 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17332  predicted protein  24.5 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  24.46 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  25.72 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  25.08 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.44 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  26.28 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  26.26 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  24.65 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  25.9 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  26.38 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  26.39 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.29 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.9 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.28 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  26.88 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  30.69 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.52 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  25.36 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  25.35 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.29 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.54 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  24.65 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  25.09 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  25.35 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  25.35 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  25.35 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.44 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  28.32 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.44 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.29 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  24.16 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  25 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  26.69 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.83 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.45 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  26.83 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  27.3 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  26.83 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  27.21 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  26.05 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  25.55 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  25.55 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  26.79 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  25.55 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  27.76 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  25.77 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  25.27 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  24.81 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  26.32 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  24.62 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  25.72 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  23.58 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  26.82 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  26.64 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  23.94 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  26.64 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  23.19 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  23.38 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  26.01 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  24.83 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  29.03 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  24.75 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  25.36 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  25.71 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>