More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1623 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  100 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  99.25 
 
 
268 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  98.88 
 
 
268 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  91.79 
 
 
268 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  77.82 
 
 
266 aa  427  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  56.34 
 
 
305 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  56.34 
 
 
305 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  53.04 
 
 
310 aa  235  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  53.77 
 
 
304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.04 
 
 
345 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  46.67 
 
 
361 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  51.8 
 
 
309 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  45.82 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  39.78 
 
 
384 aa  215  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  45.73 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  41.01 
 
 
381 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  41.43 
 
 
376 aa  208  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  43.08 
 
 
386 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  41 
 
 
399 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  44.03 
 
 
319 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  44.86 
 
 
361 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  41.38 
 
 
392 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.11 
 
 
312 aa  205  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.02 
 
 
285 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  43.68 
 
 
290 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  41.38 
 
 
380 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  42.59 
 
 
321 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  42.59 
 
 
321 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  40.3 
 
 
409 aa  198  7e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  46.22 
 
 
317 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  42.96 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  41.02 
 
 
322 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.84 
 
 
309 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  42.26 
 
 
305 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  41.51 
 
 
326 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  42.26 
 
 
305 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.21 
 
 
321 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  44.71 
 
 
319 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  41.28 
 
 
321 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  43.58 
 
 
304 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  42.92 
 
 
305 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  43.58 
 
 
304 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  43.78 
 
 
311 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.84 
 
 
305 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  42.92 
 
 
305 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  42.92 
 
 
305 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  42.92 
 
 
305 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.75 
 
 
318 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  42.92 
 
 
305 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  43.58 
 
 
304 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0404  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.1 
 
 
322 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  45.58 
 
 
305 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  44.92 
 
 
369 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  45.34 
 
 
369 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  45.15 
 
 
306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  41.61 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  44.19 
 
 
304 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  46.34 
 
 
304 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.04 
 
 
304 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  42.66 
 
 
301 aa  188  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  42.69 
 
 
327 aa  188  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.08 
 
 
261 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  42.61 
 
 
326 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  42.35 
 
 
348 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  36.97 
 
 
322 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  45.28 
 
 
312 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  45.37 
 
 
304 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  40.79 
 
 
318 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  40.79 
 
 
318 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  42.53 
 
 
285 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.07 
 
 
270 aa  186  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.55 
 
 
328 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  46.23 
 
 
398 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  42.25 
 
 
456 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  42.98 
 
 
344 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.61 
 
 
304 aa  185  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  45.92 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.06 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  47.06 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  44.12 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  47.57 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  40.69 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  44.85 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  44.85 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  43.17 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  45.58 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  44.04 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  44.78 
 
 
300 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  42.92 
 
 
403 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.46 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  38.46 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  38.46 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.46 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  45.7 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>