More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0167 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  100 
 
 		 312 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  72.73 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  68.09 
 
 		 307 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  67.2 
 
 		 321 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  26.23 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  27.21 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.76 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  28.17 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  25.52 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  26.64 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  26.64 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  26.64 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  26.64 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  26.64 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.42 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.26 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.09 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  24.09 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  25.77 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  24.89 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  27.47 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  28.68 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.86 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  27.36 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  21.71 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  26.62 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  23.32 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  26.99 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  24.45 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  26.23 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  23.69 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  24.66 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  28.15 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  22.45 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  23.22 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.75 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.75 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  23.75 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  23.75 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.88 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  23.75 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.75 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  27.98 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  23.75 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.05 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  26.21 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  22.59 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  23.98 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.02 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  23.32 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  24.07 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  26.81 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  27.52 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  22.89 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  28.65 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  23.36 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.54 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  26.48 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  27.19 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  24.82 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  24.05 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  22.54 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  24.11 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  22.77 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  24.11 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  24.11 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  21.81 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  25.74 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  25.59 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  26.7 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  21.74 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.12 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  22.45 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  25 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  23.08 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  23.43 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  23.67 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  23.39 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  23.31 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.25 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  23.25 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  28.83 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  23.25 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  23.21 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  24.87 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  23.18 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  25.87 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  23.08 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  23.05 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  24.55 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.15 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  25.22 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  24.6 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>