More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03380 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  78 
 
 
327 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  79.79 
 
 
304 aa  461  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  45.76 
 
 
378 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.05 
 
 
294 aa  252  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  42.96 
 
 
279 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  42.91 
 
 
300 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  43.12 
 
 
299 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  47.35 
 
 
297 aa  225  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  44.36 
 
 
292 aa  219  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  36.03 
 
 
311 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  36.04 
 
 
304 aa  203  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  53.59 
 
 
176 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  54.63 
 
 
118 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  30.03 
 
 
304 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.57 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  29.29 
 
 
304 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  29.02 
 
 
304 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  32.44 
 
 
322 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  33.33 
 
 
322 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  26.71 
 
 
304 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  27.44 
 
 
295 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  27.58 
 
 
322 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  32.89 
 
 
322 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.89 
 
 
322 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.89 
 
 
321 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  32.89 
 
 
322 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  32.89 
 
 
322 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.89 
 
 
321 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  32.89 
 
 
321 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  32.19 
 
 
322 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.86 
 
 
304 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  28.57 
 
 
305 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  27.3 
 
 
307 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  24.75 
 
 
312 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  28.21 
 
 
305 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.86 
 
 
305 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  27.31 
 
 
305 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  24.67 
 
 
321 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  30.71 
 
 
311 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17332  predicted protein  26.13 
 
 
385 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  28.52 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  27.86 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.19 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.24 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  25.35 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  30.6 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  27.44 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  28.67 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  26.34 
 
 
304 aa  95.9  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  29.88 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.82 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  32.18 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  24.47 
 
 
321 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  24.47 
 
 
321 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  27.5 
 
 
319 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.52 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.87 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  30.47 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  26.16 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.87 
 
 
309 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  26.9 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.44 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  26.34 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  27.44 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  27.44 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.97 
 
 
321 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  27.44 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  28.68 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.87 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.84 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  27.4 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  25.84 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  32.24 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  26.54 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  25.37 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  30.41 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  26.24 
 
 
346 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  27.21 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  25.86 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.47 
 
 
295 aa  89.7  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  25.21 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  26.67 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  26.14 
 
 
307 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.23 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  29.95 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  26.22 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  29.17 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>