More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0055 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  58.24 
 
 
322 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  50.94 
 
 
378 aa  110  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  49.49 
 
 
327 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  54.95 
 
 
304 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.35 
 
 
294 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  46.74 
 
 
300 aa  92.8  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  45.56 
 
 
299 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  48.86 
 
 
279 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  39.6 
 
 
304 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  37.19 
 
 
311 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  49.41 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  51.14 
 
 
292 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  42.34 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1074  band 7 protein  36.54 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  42.86 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  32.26 
 
 
420 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  39.08 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  44.58 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  46.67 
 
 
310 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.83 
 
 
304 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  37.38 
 
 
293 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.73 
 
 
278 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.37 
 
 
316 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  36.94 
 
 
312 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  39.77 
 
 
311 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.86 
 
 
303 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.64 
 
 
295 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  39.77 
 
 
322 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  38.64 
 
 
312 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  37.5 
 
 
318 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  37.14 
 
 
305 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  40 
 
 
414 aa  60.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  32.58 
 
 
403 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  39.77 
 
 
322 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.55 
 
 
296 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.31 
 
 
386 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  40.22 
 
 
314 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  39.77 
 
 
322 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.44 
 
 
359 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  38.89 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  33.64 
 
 
474 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  34.15 
 
 
456 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.11 
 
 
305 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  37.25 
 
 
317 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.17 
 
 
284 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  32.26 
 
 
386 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  42.17 
 
 
284 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.33 
 
 
407 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  42.11 
 
 
317 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  32.22 
 
 
398 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  36.46 
 
 
356 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  38.95 
 
 
305 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  43.24 
 
 
284 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  36.36 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  35 
 
 
324 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  37.18 
 
 
293 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  37.18 
 
 
293 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.18 
 
 
293 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  42.67 
 
 
284 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.67 
 
 
314 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  42.35 
 
 
304 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.92 
 
 
304 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  31.46 
 
 
418 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 
322 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  36.36 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  36.36 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  36.36 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.36 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  35 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  30.48 
 
 
369 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  35.87 
 
 
401 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  36.36 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  32.43 
 
 
471 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  35 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  38.64 
 
 
304 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  38.16 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  33.33 
 
 
369 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  38.89 
 
 
303 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  40.22 
 
 
268 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  40.22 
 
 
268 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  36.45 
 
 
289 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.22 
 
 
268 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.83 
 
 
318 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  37.37 
 
 
315 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  33.33 
 
 
394 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  37.38 
 
 
284 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  39.56 
 
 
336 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  35.11 
 
 
309 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  35.11 
 
 
308 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  33.65 
 
 
326 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  26.42 
 
 
307 aa  53.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  33.7 
 
 
303 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  36.36 
 
 
310 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  31.25 
 
 
395 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  38.37 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  35 
 
 
304 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  34.95 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  33.03 
 
 
312 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>