More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4626 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  95.77 
 
 
284 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  94.7 
 
 
284 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  94.7 
 
 
284 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.21 
 
 
286 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  70 
 
 
289 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  59.07 
 
 
286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  59.35 
 
 
283 aa  351  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  59.35 
 
 
284 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  58.99 
 
 
284 aa  343  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  58.99 
 
 
284 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  54.77 
 
 
284 aa  334  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  52.84 
 
 
282 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.49 
 
 
286 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  56.49 
 
 
286 aa  332  6e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  53.29 
 
 
291 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  57.91 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.81 
 
 
281 aa  311  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  47.41 
 
 
304 aa  275  8e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  42.91 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.58 
 
 
304 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  43.38 
 
 
329 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.5 
 
 
305 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  39.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  39.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  39.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  41.52 
 
 
304 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  39.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  40.69 
 
 
304 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  41.52 
 
 
304 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  42.18 
 
 
304 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  42.18 
 
 
304 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  42.18 
 
 
304 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  40.43 
 
 
305 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  40.43 
 
 
305 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  42.01 
 
 
344 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.07 
 
 
305 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.07 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.7 
 
 
328 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.58 
 
 
309 aa  222  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40.99 
 
 
336 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  41.24 
 
 
331 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.7 
 
 
334 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.69 
 
 
312 aa  221  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  41.53 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  40.88 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  42.05 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  40.88 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  41.09 
 
 
321 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  39.66 
 
 
306 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  40.53 
 
 
307 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  40.84 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  40.44 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  43.97 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  39.29 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  40.44 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  40.44 
 
 
346 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  39.27 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.32 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  36.89 
 
 
326 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  37.59 
 
 
305 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  37.93 
 
 
304 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  39.02 
 
 
318 aa  208  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  38.97 
 
 
307 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  39.02 
 
 
318 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.54 
 
 
311 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.69 
 
 
306 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  38.64 
 
 
300 aa  206  5e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  39.66 
 
 
311 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.76 
 
 
319 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  39.66 
 
 
311 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  37.91 
 
 
356 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  40.21 
 
 
326 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  38.91 
 
 
369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  40.28 
 
 
356 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  39.31 
 
 
317 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  38.91 
 
 
369 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  37.41 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  40.38 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  38.62 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  38.62 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  38.62 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.62 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  38.65 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.97 
 
 
311 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.57 
 
 
328 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.65 
 
 
359 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>