31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3458 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  92.88 
 
 		 267 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  79.85 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  55.98 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  51.19 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  41.28 
 
 		 354 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  40.51 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  57.76 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  41.92 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  39.92 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  40.65 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  36.39 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  35.64 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  39.08 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  34.53 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  39.22 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  49.06 
 
 		 173 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  44.83 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  51.11 
 
 		 97 aa  95.5  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  44.87 
 
 		 108 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  52.38 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  55.56 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  55.56 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14400  hypothetical protein  41.94 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00780659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  47.17 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  52.78 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  52.78 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  57.58 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  46 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 337 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>