12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0430 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  39.51 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6080  hypothetical protein  32.68 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0730  hypothetical protein  35.88 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14400  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00780659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0416  hypothetical protein  31.54 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0760  hypothetical protein  27.99 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4733  hypothetical protein  32.35 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  56.76 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  42.86 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3075  hypothetical protein  25.32 
 
 		 525 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755728  normal  0.783415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>