22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1018 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  71.2 
 
 
276 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  59.28 
 
 
265 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  51.11 
 
 
267 aa  177  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  44.02 
 
 
296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  56.88 
 
 
226 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  45.73 
 
 
354 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  42.51 
 
 
310 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  51.74 
 
 
269 aa  160  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  55.56 
 
 
257 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  51.57 
 
 
263 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  50.94 
 
 
267 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  50.94 
 
 
263 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  43.01 
 
 
267 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  43.81 
 
 
287 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  49.7 
 
 
265 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  39.44 
 
 
290 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  43.72 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  47.28 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  53.85 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  47.37 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  44.16 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>