22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2596 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  55 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  56.84 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  57.65 
 
 		 257 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  53.85 
 
 		 265 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  60.26 
 
 		 287 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  57.69 
 
 		 290 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  52.38 
 
 		 267 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  52.38 
 
 		 263 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  47.96 
 
 		 310 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  51.25 
 
 		 354 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  51.19 
 
 		 263 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  55.17 
 
 		 265 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  51.25 
 
 		 267 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  57.14 
 
 		 267 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  53.75 
 
 		 189 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  48.84 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  54.43 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  53.85 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  51.28 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>