22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1331 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  50.86 
 
 
257 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  49.14 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  47.92 
 
 
287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  47 
 
 
354 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  40.95 
 
 
296 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  50.3 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  45.86 
 
 
265 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  44.57 
 
 
267 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  44 
 
 
263 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  44.57 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  37.91 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  37.98 
 
 
310 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  44.21 
 
 
269 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  40.41 
 
 
267 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  41.18 
 
 
276 aa  131  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  43.72 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  45.11 
 
 
287 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  41.38 
 
 
108 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  53.25 
 
 
97 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  53.75 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>