35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1420 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  62.34 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  59 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  46.44 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  44.01 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  42.47 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  43.53 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  41.72 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  43.13 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  42.22 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  41.58 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  40.49 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  36.86 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  36.3 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  35.62 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  39.9 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  41.31 
 
 		 173 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  38.43 
 
 		 189 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  45.95 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  57.69 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  46.34 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  78.79 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  62.86 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  63.64 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  57.14 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  58.82 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  45.65 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  44.64 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  46.15 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  61.76 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0337  hypothetical protein  44.44 
 
 		 175 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1021  hypothetical protein  42.22 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>