74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2709 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  39.74 
 
 
229 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  37.61 
 
 
229 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  37.44 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  32.72 
 
 
153 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.39 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  28.05 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  30.86 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  26.62 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  26.06 
 
 
155 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  29.19 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  29.37 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  29.14 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  25.93 
 
 
165 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  28.03 
 
 
172 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  24.83 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 
479 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  24.12 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 
175 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  26.16 
 
 
189 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.72 
 
 
167 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  26.51 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  24.44 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  29.06 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  24.44 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  23.18 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.91 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  28.75 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  24.53 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.64 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  22.88 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.1 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  23.4 
 
 
504 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  24.18 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  24.18 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  29.23 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  28.81 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  23.73 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  26.19 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3144  hypothetical protein  22.61 
 
 
427 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  22.22 
 
 
182 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  23.36 
 
 
179 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  22.45 
 
 
209 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  31.43 
 
 
291 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  23.68 
 
 
189 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  24.55 
 
 
127 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  23.24 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  23.74 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  45.65 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  24.41 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  25.86 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 
575 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  20 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  23.48 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  24.22 
 
 
574 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  26.98 
 
 
170 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.79 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  29.03 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  32.05 
 
 
180 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3520  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0379927  hitchhiker  0.00134303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  23.24 
 
 
178 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  25.42 
 
 
170 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  24.3 
 
 
167 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>