25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5465 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  721    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  47.59 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  46.98 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  42.27 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  44.44 
 
 		 290 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  40.45 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  40.97 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  40.45 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  36.83 
 
 		 267 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  43.57 
 
 		 287 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  41.22 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  40.94 
 
 		 263 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  51.5 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  41.89 
 
 		 263 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  41.28 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  42.21 
 
 		 276 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  51.78 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  46.6 
 
 		 189 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  45.73 
 
 		 173 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  57.69 
 
 		 97 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  51.95 
 
 		 108 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  51.25 
 
 		 101 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  52.78 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>