33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3334 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  79.85 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  79.34 
 
 		 267 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  56.59 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  50.79 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  41.41 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  51.35 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  38.79 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  37.23 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  40.53 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  35.43 
 
 		 296 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  39.69 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  43.54 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  34.46 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  34.54 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  50.94 
 
 		 173 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  33.1 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  37.18 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  44.25 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  47.78 
 
 		 97 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  39.74 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  51.19 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  60 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  50.94 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  55.88 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  55.88 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  52.94 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  54.55 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  48.08 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0737  hypothetical protein  57.14 
 
 		 118 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  37.18 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  42.42 
 
 		 203 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>