23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4518 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  43.97 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  36.83 
 
 		 354 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  39.24 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  41.81 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  36.77 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  37.12 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  35.86 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  39.53 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  38.85 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  36.11 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  39.33 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  41.88 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  43.01 
 
 		 173 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  33.8 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  34.89 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  32.38 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  40.41 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  52.63 
 
 		 97 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  43.53 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  51.25 
 
 		 101 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  42.11 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>