25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3874 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  36.8 
 
 		 293 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0730  hypothetical protein  30.31 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0760  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14400  hypothetical protein  31.94 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00780659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6080  hypothetical protein  31.12 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0416  hypothetical protein  31.88 
 
 		 290 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4733  hypothetical protein  29.19 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  63.64 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  57.58 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  40.45 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  66.67 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  60.61 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  60.61 
 
 		 226 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  63.64 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  52.78 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  48.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  54.55 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  65.52 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  60.61 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  65.52 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  53.85 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  53.85 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3075  hypothetical protein  25.45 
 
 		 525 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755728  normal  0.783415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>