24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2067 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  55.1 
 
 
97 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  58 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  57.69 
 
 
226 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  57.97 
 
 
257 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  54.67 
 
 
287 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  54.05 
 
 
296 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  51.81 
 
 
265 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  51.95 
 
 
354 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  41.38 
 
 
267 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  41.38 
 
 
263 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  45.57 
 
 
269 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  41.38 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  43.53 
 
 
267 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  48.72 
 
 
265 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  45.95 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  46.15 
 
 
267 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  42.68 
 
 
310 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  46.75 
 
 
287 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  36.78 
 
 
263 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  46.84 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  47.37 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  45 
 
 
2449 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  37.8 
 
 
2397 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>