29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1751 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  47.64 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  40.78 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  45.04 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  42.63 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  40.34 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  41.39 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  41 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  43.11 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  44.14 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  43.06 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  39.84 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  38.77 
 
 		 267 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  51.11 
 
 		 173 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  37.74 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  38.4 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  36.88 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  44.69 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  38.3 
 
 		 189 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  46.43 
 
 		 97 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  57.14 
 
 		 101 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  60.61 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  61.76 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  57.14 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  36.76 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  60 
 
 		 337 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  54.29 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>