27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3304 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  48.44 
 
 		 265 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  44.62 
 
 		 310 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  43.89 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  45.15 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  46.55 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  43.22 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  41.81 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  47.6 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  48.61 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  43.01 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  40.36 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  41.45 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  52.22 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  39.71 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  38.91 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  46.99 
 
 		 173 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  38.13 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  45.65 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  46.75 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  52.5 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  52.5 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  51.28 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>