24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0622 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  46.5 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  46.15 
 
 		 226 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  43.18 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  40.34 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  42.05 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  40.32 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  39.45 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  44.48 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  51.85 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  40.29 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  40.8 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  35.45 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  40.83 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  40.51 
 
 		 263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  37.96 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  38.13 
 
 		 267 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  47.92 
 
 		 189 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  43.81 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  58.02 
 
 		 97 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  54.67 
 
 		 108 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  60.26 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  60.61 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  52.63 
 
 		 349 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>