23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0641 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  60 
 
 		 269 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  47.64 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  42.9 
 
 		 296 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  47.43 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  40.45 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  48.79 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  39.45 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  44.27 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  40.82 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  41.5 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  39.24 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  59.28 
 
 		 173 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  40.08 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  39.69 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  38.26 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  45.86 
 
 		 189 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  48.72 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  47.37 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  55.17 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4330  hypothetical protein  64.71 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.276009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  41.46 
 
 		 370 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>