12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4330 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4330  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.276009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1024  hypothetical protein  53.33 
 
 
153 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1166  normal  0.043533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4319  hypothetical protein  30.82 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0495  hypothetical protein  31.29 
 
 
176 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000122319  hitchhiker  0.00125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1106  hypothetical protein  32.57 
 
 
172 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1036  hypothetical protein  26.81 
 
 
188 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1884  hypothetical protein  32.05 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  64.71 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2772  hypothetical protein  31.11 
 
 
1460 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00073265  decreased coverage  0.0000304367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  57.14 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0646  hypothetical protein  32.32 
 
 
161 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  55.56 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>