15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0737 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0737  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  220  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849645  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4743  hypothetical protein  39.17 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6597  hypothetical protein  42.45 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1495  hypothetical protein  63.89 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2934  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  49.06 
 
 
267 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  56.41 
 
 
263 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03220  hypothetical protein  36.96 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  65.52 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  57.14 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1369  hypothetical protein  42.28 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.591304  normal  0.424968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3769  hypothetical protein  68.97 
 
 
245 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  55.26 
 
 
112 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  45.65 
 
 
129 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0755  putative transmembrane protein  54.55 
 
 
105 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0258278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>