13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1644 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  64.84 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  48.41 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  49.6 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  50.4 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  40.8 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  43.24 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  42.24 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  38.32 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  37.61 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  39.17 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  38.33 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  56.1 
 
 		 292 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>