12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4743 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4743  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  240  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2934  hypothetical protein  55.12 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6597  hypothetical protein  40.98 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0737  hypothetical protein  39.17 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849645  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  57.5 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0495  hypothetical protein  63.64 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000122319  hitchhiker  0.00125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1106  hypothetical protein  60.61 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  61.29 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  42.11 
 
 
287 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0646  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  38.27 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3047  hypothetical protein  56.67 
 
 
236 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>