91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2882 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  50.77 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.23 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  47.69 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  35.38 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  38.71 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  43.33 
 
 		 419 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  37.31 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  43.1 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 		 474 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 512 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  36.67 
 
 		 244 aa  50.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 547 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 481 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  31.43 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 484 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  36.84 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 306 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  31.11 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  52.78 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 847 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4743  hypothetical protein  61.29 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  39.62 
 
 		 555 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 419 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 533 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  34.43 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3047  hypothetical protein  59.46 
 
 		 236 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 497 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 427 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1049  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  43.75 
 
 		 491 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  30.88 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  38.1 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  40.38 
 
 		 445 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 96 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 418 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  35.85 
 
 		 582 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 394 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  30.91 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 416 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  30.91 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  32.2 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  40.79 
 
 		 421 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>