55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4216 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 511 aa  987    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  64.4 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  26.45 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.07 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  30.59 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  28.42 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  49.51 
 
 		 399 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  26.96 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  25.33 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  36.81 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  34.57 
 
 		 178 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  42.47 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.79 
 
 		 2449 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 98 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 92 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.67 
 
 		 86 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 114 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  43.28 
 
 		 103 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  31.78 
 
 		 469 aa  53.5  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 71 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  30.68 
 
 		 533 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 		 127 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 		 97 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 394 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  29.68 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 547 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  36.14 
 
 		 124 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.74 
 
 		 2179 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 59 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  27.71 
 
 		 174 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  30.34 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.07 
 
 		 129 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.78 
 
 		 1888 aa  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 61 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  41.43 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 161 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 		 96 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 82 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 		 96 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 81 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 184 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 68 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 68 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 		 66 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 177 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 84 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>