27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2584 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  920    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 474 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  33.77 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  43.95 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  28.57 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.59 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  25.18 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  32.24 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  36.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 86 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  35.43 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  42.62 
 
 		 240 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  27.15 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  33.33 
 
 		 127 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 124 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 71 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 98 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  35 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 92 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  30.56 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 68 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 103 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  24.39 
 
 		 127 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  28.03 
 
 		 306 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>