59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3826 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  100 
 
 		 445 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  66.35 
 
 		 511 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  37.38 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.49 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  30.34 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  30.22 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  29.11 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  28.38 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  26.15 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  29.59 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  25.58 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  24.79 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  42.47 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  33.73 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 		 86 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  24.74 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  29.98 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 86 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 92 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 		 98 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 114 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 71 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 103 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  40.85 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  29.75 
 
 		 127 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 97 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  28.47 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  27.71 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  34.85 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 124 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.07 
 
 		 129 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 61 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 		 96 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 82 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 59 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  29.57 
 
 		 127 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 108 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 81 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0913  phage shock protein C, PspC  27.36 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  39.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.85 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 68 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 177 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 		 66 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 58 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 77 aa  43.1  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  29.66 
 
 		 847 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.5 
 
 		 2914 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  34.25 
 
 		 100 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>