85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1735 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  100 
 
 		 445 aa  879    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0913  phage shock protein C, PspC  32.37 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.54 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  30.79 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  31.16 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  25 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  31.65 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.07 
 
 		 92 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  51.92 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 98 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  52.63 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  48.08 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  30.95 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  55.32 
 
 		 66 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 127 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 127 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.28 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  51.06 
 
 		 107 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 71 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 165 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 95 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 62 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  49.06 
 
 		 59 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 161 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  32.14 
 
 		 82 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 68 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  50.94 
 
 		 84 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  43.42 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  36.92 
 
 		 70 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  41.07 
 
 		 127 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.4 
 
 		 61 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 85 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 177 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40.68 
 
 		 178 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  38.18 
 
 		 240 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  51.92 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 68 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 96 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.73 
 
 		 152 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 108 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 62 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 108 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 194 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 67 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 547 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 86 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  31.51 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 67 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  37.5 
 
 		 244 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 65 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  30 
 
 		 79 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 87 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  26.85 
 
 		 847 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 96 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 85 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  35.43 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  29.06 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 110 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  46.81 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 64 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 110 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 64 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 110 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 138 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 76 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  34.55 
 
 		 86 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 58 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.64 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  46.81 
 
 		 83 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 233 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 533 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 82 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>