79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3002 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 85 aa  167  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  78.31 
 
 		 83 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  60.26 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.38 
 
 		 533 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 464 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  41.98 
 
 		 512 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  58.33 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 547 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  44.62 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  42.03 
 
 		 497 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2395  phage shock protein C, PspC  45.95 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.068656  normal  0.225088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  41.98 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  43.24 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  46.81 
 
 		 445 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 468 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  46.94 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 394 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  47.83 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 		 484 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  35.85 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.58 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 466 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  36.62 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  36.84 
 
 		 419 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  36.54 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 847 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 398 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  36 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.18 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  37.78 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 61 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 455 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38 
 
 		 82 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 174 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 416 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 418 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 419 aa  41.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  36 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  31.75 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.3 
 
 		 143 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 98 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  34.69 
 
 		 445 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>