36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2714 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
83 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  78.31 
 
 
85 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  55.84 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 
512 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 
464 aa  60.1  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  43.06 
 
 
547 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  48.48 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
497 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 
552 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  40.91 
 
 
491 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  45.21 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 
468 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.1 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2395  phage shock protein C, PspC  44.59 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.068656  normal  0.225088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  44.9 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 
87 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  33.33 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  32.69 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  46.81 
 
 
445 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  34 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  33.96 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  38 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 
64 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 
427 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  38 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>