81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0279 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 		 497 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  47.79 
 
 		 547 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  44.95 
 
 		 512 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  54.26 
 
 		 533 aa  84.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  57.14 
 
 		 552 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  41.88 
 
 		 464 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  53.4 
 
 		 468 aa  73.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  48.65 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.15 
 
 		 419 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 354 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  45.21 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  43.24 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 481 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  49.09 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  53.23 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  45.83 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  55.56 
 
 		 445 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 418 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  37.97 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  51.11 
 
 		 418 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  47.14 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 458 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  39.44 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  30.88 
 
 		 555 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  46.15 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  38.96 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 416 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 474 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  34.57 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  55.1 
 
 		 394 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  33.71 
 
 		 511 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 400 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.46 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  54.35 
 
 		 417 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  37.04 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  48.94 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  32.1 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 152 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  46.77 
 
 		 82 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  40.35 
 
 		 445 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.27 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  38.3 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  43.4 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  33.73 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>