125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4257 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.25 
 
 		 847 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 847 aa  1719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  28.61 
 
 		 582 aa  138  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  28.04 
 
 		 578 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  26.26 
 
 		 515 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  29.93 
 
 		 601 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  32.81 
 
 		 231 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  29 
 
 		 239 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  27.93 
 
 		 452 aa  88.2  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  29.78 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.1 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 76 aa  61.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 127 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.29 
 
 		 79 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  27.55 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  41.07 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 95 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  34.23 
 
 		 128 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  34.23 
 
 		 128 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  34.23 
 
 		 128 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 61 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  24.29 
 
 		 231 aa  55.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 108 aa  55.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  34.51 
 
 		 96 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  41.82 
 
 		 70 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.1 
 
 		 82 aa  55.1  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  32.43 
 
 		 128 aa  54.7  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  38.24 
 
 		 136 aa  54.7  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 246 aa  53.5  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 61 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  23.83 
 
 		 231 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  28.78 
 
 		 170 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 62 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 85 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  37.97 
 
 		 97 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 		 77 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 107 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 128 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 128 aa  52.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 128 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 128 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 128 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  51.6  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  24.59 
 
 		 217 aa  52  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  26.15 
 
 		 273 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 174 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  34.55 
 
 		 92 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 67 aa  51.2  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  33.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 		 71 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 		 81 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 61 aa  50.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 108 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 177 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 256 aa  50.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 152 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  28.04 
 
 		 216 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  24.51 
 
 		 248 aa  49.7  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 153 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 		 96 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 68 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  20.63 
 
 		 244 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 68 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  22.75 
 
 		 244 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  43.64 
 
 		 129 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 64 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  30.12 
 
 		 86 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 138 aa  48.5  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  30.7 
 
 		 131 aa  48.5  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 164 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  46.94 
 
 		 128 aa  48.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  24.65 
 
 		 233 aa  48.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 131 aa  47.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 98 aa  47.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 59 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 458 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 165 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  23.4 
 
 		 237 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  44.64 
 
 		 131 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 87 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 194 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 169 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  29.2 
 
 		 129 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 77 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 61 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>