160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2350 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  71.65 
 
 		 177 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  41.24 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  42.48 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  34.52 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  33.82 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  56.76 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  55.74 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  57.89 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  55.74 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  51.72 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  31.63 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  57.89 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.18 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  51.56 
 
 		 65 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  50 
 
 		 70 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  41.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  55.88 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  23.96 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  31.66 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  63.83 
 
 		 81 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  43.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  49.25 
 
 		 346 aa  64.7  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.32 
 
 		 86 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  47.37 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  41.79 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  46.55 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.59 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 847 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  55.81 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  28.06 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  46.43 
 
 		 419 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  32.91 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  38.81 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  43.33 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 394 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 61 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  39.29 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  47.83 
 
 		 77 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  46.77 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  38.75 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  35.53 
 
 		 86 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 458 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.26 
 
 		 87 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  34.15 
 
 		 96 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 108 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  37.04 
 
 		 128 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  52.27 
 
 		 74 aa  51.6  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 497 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 96 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  36.11 
 
 		 131 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 67 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 84 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  44.64 
 
 		 555 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 59 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 		 547 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  53.66 
 
 		 64 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 77 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  37.93 
 
 		 515 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 404 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 68 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  41.94 
 
 		 469 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  35.79 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 578 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  36.99 
 
 		 110 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.55 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>