148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0952 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  24.62 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  35.51 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  30.43 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  30.73 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 127 aa  62  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  33.06 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  50 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  30.25 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  39.66 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  29.09 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  43.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 578 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.46 
 
 		 248 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 81 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  28 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  46.3 
 
 		 70 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 346 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  37.78 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  37.78 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  43.33 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 92 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 68 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  51.72 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  41.33 
 
 		 847 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  37.36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  45.59 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  27.55 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  45.9 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  47.46 
 
 		 515 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  35.56 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 97 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  46.67 
 
 		 119 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  46.67 
 
 		 119 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 64 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  32.1 
 
 		 86 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  39.66 
 
 		 582 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  35.96 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  32.39 
 
 		 127 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 67 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  37.93 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  39.34 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 497 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 66 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.16 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  27.72 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  36.67 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  36.67 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  36.67 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  35.59 
 
 		 81 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  36.67 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 67 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  35 
 
 		 61 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  37.29 
 
 		 240 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.1 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.21 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 77 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.1 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.1 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 394 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  35 
 
 		 61 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  42.22 
 
 		 74 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 85 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>