96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0248 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
346 aa  694    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  48.44 
 
 
95 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  48.44 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.39 
 
 
92 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  43.37 
 
 
81 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
71 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 
194 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.8 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.66 
 
 
248 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  40.26 
 
 
103 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  50.94 
 
 
66 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
174 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  56.9 
 
 
127 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  46.77 
 
 
81 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
68 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 
61 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 
169 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 
131 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 
97 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 
87 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
149 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  55.17 
 
 
127 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
62 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
129 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
131 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 
85 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  31.07 
 
 
152 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  44 
 
 
131 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  47.62 
 
 
129 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  35.14 
 
 
164 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  43.55 
 
 
131 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 
143 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.14 
 
 
138 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  37.97 
 
 
131 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 
170 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
128 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  38.6 
 
 
128 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
128 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
128 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
128 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
128 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  35.24 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 
128 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 
128 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 
128 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  35.21 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 
86 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 
132 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  40 
 
 
244 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  41.67 
 
 
148 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 
416 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 
119 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
58 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 
578 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  27.91 
 
 
153 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
107 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.1 
 
 
86 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
847 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  41.67 
 
 
127 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  30.1 
 
 
86 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  29.93 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 
86 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 
76 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  46.03 
 
 
128 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
161 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  27.96 
 
 
140 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  48.84 
 
 
77 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 
98 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  34.85 
 
 
136 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 
65 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  45.24 
 
 
64 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 
77 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  39.34 
 
 
70 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
83 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.94 
 
 
178 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  28.26 
 
 
147 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 
61 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
512 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  35.38 
 
 
129 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  38.98 
 
 
515 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 
84 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.38 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 
66 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 
108 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 
96 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 
86 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>