94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0588 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  44.3 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  47.69 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  45.9 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  35.06 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  37.18 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  31.17 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.59 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
77 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  32.14 
 
 
86 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 
95 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 
64 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  41.07 
 
 
244 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  35 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  43.33 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  37.14 
 
 
306 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  31.75 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 
190 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.82 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  38.98 
 
 
582 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  35.94 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  48.57 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  32.84 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  43.9 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  46.34 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  30.26 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  28.21 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  39.02 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
847 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 
346 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  48.72 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  30.38 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  46.88 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  32.1 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  46.88 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  36.36 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  26.67 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 
77 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 
165 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2057  phage shock protein C, PspC  41.46 
 
 
70 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.855415  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  35.82 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
458 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
484 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  30.77 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  32.05 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  29.49 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  29.49 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  29.49 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.5 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  32.2 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  36.23 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>