103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3770 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  48.99 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  48.03 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  43.42 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  46.71 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  43.84 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  43.84 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  44.52 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  44.52 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  44.52 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  44.52 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  44.52 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  44.74 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  43.06 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  43.84 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  43.15 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  42.36 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  41.72 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  42.76 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  41.38 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  43.45 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  38.62 
 
 		 129 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  39.86 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  32.17 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  41.89 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  27.81 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  27.63 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  27.81 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.25 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.42 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  47.46 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.76 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  29.61 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.12 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.09 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.09 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.09 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  30.43 
 
 		 578 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  45.59 
 
 		 170 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1216  hypothetical protein  27.82 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 847 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  28.17 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  41.79 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  23.68 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.67 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  38.6 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  34.85 
 
 		 351 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  36.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.8 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.11 
 
 		 515 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  28.87 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  26.87 
 
 		 119 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 346 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 61 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 416 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  32.91 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  36.23 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  35.82 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  33.73 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  36.23 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  33.82 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  33.78 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2212  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1310  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 		 49 aa  40  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000931741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>