68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0421 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  35.29 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  39.13 
 
 		 847 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  42.86 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40.32 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  39.62 
 
 		 351 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 477 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  37.84 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  46.81 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  45.61 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  34.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  42.59 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 394 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  43.48 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.74 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 		 67 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 68 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.84 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 371 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  46.94 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  33.85 
 
 		 515 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.64 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  43.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 346 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  35.48 
 
 		 445 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  33.85 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 481 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  41.51 
 
 		 129 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 578 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>