52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5559 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
371 aa  723    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  52.73 
 
 
108 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  38.02 
 
 
497 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.89 
 
 
129 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  33.91 
 
 
511 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.86 
 
 
127 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
110 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
110 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
110 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  43.1 
 
 
445 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
64 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 
92 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
68 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
481 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 
82 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
59 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  41.03 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
86 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 
95 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.85 
 
 
79 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  36.36 
 
 
82 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 
143 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 
86 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
81 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 
124 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
547 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  36.62 
 
 
108 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  43.1 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 
512 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  31.75 
 
 
244 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 
97 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
114 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  45.28 
 
 
445 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 
847 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
62 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  34.23 
 
 
555 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  35.14 
 
 
76 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 
98 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.84 
 
 
165 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  27.82 
 
 
515 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 
107 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 
85 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  33.77 
 
 
119 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 
71 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 
177 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>